中心领导均来自中国科学院系统各学术领域的著名院士专家，为中心的业务发展不仅提供指导方向，同时也从各自学术领域提供咨询与技术支持。
李振声
中心名誉主任
中国科学院院士
国家最高科技奖获得者（2006年）
中心理事长、法人代表
中国科学院院士
著名数学家
林 群
中心副理事长兼主任
中国科学院院士
著名地质学家
中心副理事长
中国科学院院士
生物化学、生物物理学家
刘嘉麒
王志新
齐在元
中心副理事长
中国科学院大学原副校长
中心理事
国家天文台原党委书记
探月工程总体部主任
吕晓澎
中心常务副主任
副译审
欧美同学会中东欧分会秘书长
中心副主任
中国科学院研究生院应急管理研究中心主任
刘晓群
黄 钧
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